ВНИКИ осуществляет анализ и мониторинг транспортных потоков, объёмов внешнеторговых грузов, а также прогноз их развития для транспортных коридоров, морских портов и терминалов, в том числе для подготовки технико-экономических обоснований и бизнес-планов.
Институтом успешно выполнены работы по анализу и прогнозу внутрироссийских и международных транспортных грузопотоков, включая транспортные коридоры «Север – Юг» и «Запад – Восток», паромную переправу «Усть-Луга - Балтийск - порты Германии», терминально-складской комплекс в Республике Алтай, железную дорогу Беркакит – Томмот – Якутск и многие другие.